WB内参曝光但目标基因带空白——个人经验丰富!
今天天气非常冷。我没有像昨天那样睡得很晚,只是起得很早。
因为我有一些最后的实验要完成,然后告别实验室大约两个月。有点伤感,回顾这两个月在实验室成长的点点滴滴,有过辛苦的汗水,有过失败的苦恼,也有过成功的喜悦...
刚掌握了一些实验技能,就要无情的离开,真的有点难过。毕竟等我回到这里,这些技能都可能还回来。
反正这只是暂时的告别,只是为了整理之前的数据,然后更好的设计和规划后续的实验。
到了实验室,我们完成了最后一波免疫组化的后续部分。继续完成昨天洗脱的WB(这个洗脱液效果不错。但是成绩并没有太大的提升。一个新的发现是曝光时间。这次我按照说明书的图例把曝光时间调到600秒,居然爆发了。)
鉴于昨天的问题——WB内参用完了,但目的基因带是空白的,今天我来回答一下。
1,一级阻力和二级阻力混淆了吗?
答:结合两次实验的结果,说明我没有混淆一抗和二抗的种类。
2.胶水切错了,导致目标条缺失?
回答:切胶没问题,切内参带有问题。抗体说明书分子量为36KD,实际分子量为39KD。
3.组织蛋白表达太少?
答:这是最有可能的。目前我的WB蛋白是30ug,可以考虑进一步用50ug左右。
4.因为目标蛋白是催化酶,不使用相关蛋白酶抑制剂(如cokertail等)会不会导致蛋白丢失。)?
答:蛋白酶抑制剂PMSF效果还可以,以后有条件可以考虑其他蛋白酶抑制剂。
5.蛋白质(两周前)存放时间太长,蛋白质降解?
答:也可能有这个因素,导致蛋白质消耗减少。建议尽快完成蛋白质提取。
6.膜转移时间(300mA,2h)过长,导致蛋白质透过膜。
答:有两种目标蛋白。今天一个蛋白(64KD)被我曝光,另一个蛋白(52KD)一直空白。高度怀疑膜转移导致蛋白质丢失。参考别人的建议,转片条件可以设置为:200mA,1min /1KD。
7.电泳液用的时间太长(我懒得用别人的电泳液——十天前跑了一次)?
答:实践表明影响不是特别大,可能会影响膜上蛋白质的均一性。
8.曝光时间太短?
答:对于表达量非常低的蛋白质,建议延长暴露时间。比如今天我把曝光时间设为500秒,300秒才看到条纹。虽然很弱,但我也找到了结果,对问题消除带来了很大的帮助。
补充两个问题:
9.抗体浓度有问题吗?可能太低了。能改善吗?
答:对于52KD蛋白,我把浓度提高了一倍,但还是没有暴露。所以对于WB白片来说,这个浓度的影响力应该排在比较靠后的位置。
10,曝光液的感光度?
答:这是关键因素之一。第二次运行,在蛋白含量不变的情况下,我控制了转膜时间,不到90分钟,制备了新鲜抗体,使用了超敏感的ECL暴露液(第一次只使用了增强型ECL暴露液),这次效果特别好。所以我建议用超感光曝光液。
是时候说再见了,但我相信这不是永远!