写论文使用项目案例是否违反保密协议?

不完全是。

1.学位论文选题涉及国家科技秘密或者国防军工科技秘密项目,论文内容包含涉密科研项目全部或者部分内容的,可以视为涉密学位论文。

2、学位论文选题依托横向项目,项目承担单位与委托单位签订保密协议,可申请列为学位论文。

3.论文涉及专利申请的,按照国家有关专利申请管理的规定执行。专利审批机关明确需要保密的,可以申请根据专利审批机关的最终意见进行保密的学位论文;审批意见尚未形成时,不得作为学位论文鉴定的依据或理由。