发表论文的发票由第三方开具。能报销吗？

当然可以。发表论文开具的发票是第三方，可以报销。但需要提供开票单位和出版单位是隶属关系的证明，报销人提供的报销收据票据必须是纸质出版单位，否则发票盖章与期刊出版单位不一致，不予报销。