一篇关于基因图谱研究进展的论文得高分
随着基因图谱技术的发展,其概念的内涵也在不断深化。早期的基因定位主要是指区分基因是否连锁,是否位于常染色体或性染色体上。目前,它包括遗传作图以了解基因在连锁群上的相对位置和物理作图以了解基因在一条染色体上的具体位置。作图的内容包括QTL基因和分子遗传标记(主要是微卫星位点、RFLP等。)除了品质性状基因。基因染色体定位的方法很多,其中主要的物理方法包括传统的荧光原位杂交(fish)和辐射杂交(RH)等。FlSH技术虽然可以对基因染色体进行定位,但从分子角度来看,其定位工作还比较粗糙,RH定位精度高于FlSH定位,是一种低成本、高效率的基因染色体定位新方法,在遗传学研究中发挥着越来越重要的作用。
然后可以从一个方向讨论基因图谱:
如大米:/periodic _ xmdxxb200706023.aspx。
猪:目前用于猪基因物理定位的体细胞杂种细胞系有:法国猪?辐射杂交克隆板(INRA-明尼苏达猪辐射杂交板)由猪×啮齿动物体细胞杂交板(SCP),法国农业科学院和明尼苏达大学* * *,IMpRH),日本Susscrofa辐射杂交板(SSRH),英国Roslin Research和剑桥大学联合构建的猪辐射杂交板(李琳,2004)。目前广泛使用的是前两种,两者的相似之处在于都是基于PCR分型,方便快捷。
猪?啮齿动物体细胞杂种板由法国农业科学院(Labatoire de Gé né tique celluare,INRA,Castanet-Tolosan,法国)构建,由27个杂种细胞系组成(Yerle等人,1996)。体细胞杂交板中使用的供体细胞是猪淋巴细胞或成纤维细胞,然后与中国仓鼠黄嘌呤磷酸核糖转移酶缺陷(HPRT-)细胞株(1-19杂交细胞系)和小鼠胸腺嘧啶激酶缺陷(TK-)细胞株(20-27杂交细胞系)融合,最后通过细胞遗传学方法鉴定。用PCR检测某基因在27个杂交细胞系中的基因分型结果,然后用每个杂交细胞种的猪染色体或片段进行相应的分析,就可以得到该基因在猪染色体上的区域定位结果(Chevaliet et al .,1997)。这种方法只能将基因定位在一个粗略的染色体位置上。
猪辐射杂交克隆平板IMpRH由法国农业科学院和明尼苏达大学(Yerle等,1998)构建。7000拉德辐射后,猪淋巴细胞或成纤维细胞供体细胞与中国仓鼠受体细胞融合,获得152个杂交细胞克隆。以FISH(小交错重复元件)为探针,以特异性SINE为引物的PRINS技术对每个杂交细胞系中染色体或片段的大小和长度进行细胞遗传学鉴定后,获得了一套覆盖整个猪基因组的猪辐射杂交板(Yerle等,198+08杂交细胞系)。霍肯等人(1999)用IMpRH分析了900多个ⅰ
利用ⅰ类和ⅱ类标记构建了第一代猪全基因组辐射杂交图谱。该图谱* * *由128个连锁群(坐标最小LOD值为4.8)和59个个体标记组成,覆盖所有常染色体和X染色体,理论分辨率为145kb,平均存活率为29.3%,平均约为70 kb/cR。第一张猪辐射杂交图谱的构建,为新DNA标记的定位提供了丰富的DNA坐标,为构建猪基因组高分辨率物理图谱奠定了基础,因此这套克隆板得到了广泛应用。由于RH法是一种基于PCR分型检测技术与互联网相结合的定位方法,对于118克隆的IMpRH板,在引物特异、扩增效率高、条件稳定的情况下,可在一天内将分析结果提交至相应网站并获得最终定位结果,因此具有快速、简便、定位准确度高的特点,结果具有可比性。与连锁图谱相比,辐射杂交克隆板可以相对准确地定位和排列标记,可以将遗传连锁图谱中5cM以内难以区分的标记聚类排序(Rohrer et al .,1996;霍肯等人,1999;李琳,2004年)。除了定位特定的DNA标记,随着ESTs数据库的海量增长,RH法在定位ESTs上也显示出了广阔的应用前景。Cirera等(2003)通过IMpRH从小肠cDNA文库中成功定位了214个ESTs。Tuggle等人(2003)也使用IMpRH定位了64个主要在母猪生殖器官中表达的ESTs。
希望这有所帮助