谁负责纸张取样？

教育部。根据中华人民共和国教育部政府门户网站发布的《办法》第二条、第四条规定，教育部负责本科毕业论文抽样检查的总体组织和监督工作，省级教育行政部门负责本地区本科毕业论文抽样检查的具体实施。本科毕业论文抽样每年进行一次，抽样对象为上一学年授予学士学位的论文。