如果本科毕业论文中有三个序号与文章中的序号不同，会影响抽检吗？

不会，根据论文发表的查询，只要不涉及学术诚信和政治问题，就可以通过学术论文答辩，不会影响抽检。毕业论文是学生为了专心从事本专业学生的科学研究和培养而要求在毕业前写的论文。会安排在最后一个学年(学期)。