教育部能看到大学生论文联合比对数据库吗？

是的。根据中华人民共和国政府门户网站和中国教育部的规定，教育部有权查询所有的教育咨询网站和论文，所以可以看到。中华人民共和国教育部是中华人民共和国国务院主管教育和语言文字工作的部门。