如何分析基因测序的结果
你可以用另一端的引物测序,你可以从序列的另一端到末端测量序列,这样你就可以得到你的引物在序列末端的反向互补序列。
如果你想利用你现有的数据找到与疾病相关的基因/通路/网络,那就走出去,直奔差异表达分析。
首先看测序峰图。如果结果的彩色图谱显示峰型尖锐单一,与碱基对应的编码一致,则可以判断该序列可以使用。如果出现双峰、信号中断等异常现象,需要重新制备或克隆后再测序。
通常,靶基因相对于标准基因的倍数可以通过荧光定量PCR来确定,并且靶基因的数量可以通过选择某个基准来获知。但有时由于DNA样本量少,会采用第二代高通量测序法检测染色体倍数。
基因序列测序后,一般需要对序列进行比对,看它和目标序列的区别。常用的软件是DNAman,invitrogen的vectorVI也不错。另外也可以直接在网上对比,建议NCBI网站的爆破可以直接在网上进行。
克隆入质粒载体并集中测序[9,10]。sAGE的最终结果是通过计算机统计得到的,根据一个标签出现的频率来判断和计算基因表达的丰度。