侯云德的学术成就。
2.中药黄芪对干扰素的抗病毒作用进行了开创性的研究。发现黄芪能抑制某些病毒的繁殖，诱导干扰素，增加NK细胞活性，促进19S抗体形成细胞sIgA水平的产生，延长二倍体细胞体外存活时间。临床证实了黄芪可以预防感冒，并发现了黄芪与干扰素的协同作用。
3.发现人脐带血白细胞具有较强的诱生干扰素的能力，筛选出一株高产病毒株NDV-F，并最终研制成临床干扰素制剂。
4.他研发了包括α1b、α2a、α2b、γ等亚型在内的一系列基因工程干扰素产品，其中重组α1b和α2a干扰素于1992年获得国家新药证书。重组干扰素α1b是一种世界首创的新药产品，也是我国首个基因工程多肽药物。
5.成功构建了原核高效表达载体pBV220系列和pBV320系列通用高效表达载体。
6、干扰素研究
侯云德同志对干扰素的研究是从副流感病毒的研究开始的。早在50年代末，我在苏联呆的时候，就发现仙台病毒有不同的变种，并证明了它对人的致病性。发现了病毒在单层细胞培养中的急性细胞融合现象，并阐明了其机理。后来在70年代发展成为基因研究的重要手段时，他的相关著作受到广泛重视。由于他在科研方面的突出成就，前苏联高等教育部超越副博士学位，直接授予他苏联医学博士学位。回国后，他在中国分离出副流感病毒I、II和IV。
20世纪70年代初，他开创性地研究了中药黄芪对干扰素的抗病毒作用，发现黄芪能抑制某些病毒的繁殖，诱导干扰素，增加NK细胞的活性，促进19S的抗体形成细胞产生sIgA，延长二倍体细胞体外存活时间。临床证实了黄芪可以预防感冒，并发现了黄芪与干扰素的协同作用。
20世纪70年代中后期，侯云德同志对人白细胞中干扰素的诱导和纯化进行了深入研究，发现人脐带血白细胞具有较强的干扰素诱导能力，并选育出高产病毒株NDV-F，最终研制出临床干扰素制剂。1979年，他在非洲鲫鱼卵母细胞中发现了干扰素mRNA的翻译系统，因其操作系统简单而受到当年国际干扰素大会的高度评价，随后入选著名的酶学方法系列。1982年发表了IFN-α cDNA克隆与表达的论文，成为我国基因工程研究的开创性文献之一。随后在1983，他成功利用TGATG序列融合了α1干扰素蛋白。1984年，他在研究重组干扰素基因的表达载体。1987年，他和他的学生组成了温控原核高效表达载体pBV220系列，已在全国广泛推广。在1990中，建立了具有原核增强子样序列的pBV320系列通用高效表达载体。经过10多年的不断努力，他研制出了包括α1b、α2a、α2b、γ等亚型在内的一系列基因工程干扰素产品，其中重组α1b和α2a干扰素于1992年获得国家新药证书。重组干扰素α1b是一种世界首创的新药产品，也是我国首个基因工程多肽药物。与国外同类产品相比，具有副作用小的优点。因此获得1993国家科技进步一等奖。已获得5个基因工程产品新药证书。
近年来，在干扰素基因改造、靶向干扰素、妊娠干扰素、中国人类基因组干扰素等位基因的开发等方面取得了突出的成就。1992年，他在中国发现、克隆并表达了α1干扰素基因的两个新等位基因，进一步证明了新发现的α1c/d基因在部分中国人群中占优势。在1987-1992中，他先后通过基因改造获得了活性明显提高的α1/86D干扰素突变体和γ干扰素与上皮生长因子的融合蛋白。1992年克隆表达了可能与生殖生理有关的中国人ω干扰素基因，并在1992年开发了肿瘤细胞导向基因。这些努力使中国的干扰素研究能够紧跟国际前沿趋势并有所创新。因其对中国干扰素基因工程的开创性贡献，连续两年当选为国际干扰素协会理事中国代表。
7.痘苗病毒基因组结构和功能的研究。
痘苗病毒是最大的动物病毒，对其基因组结构和功能的研究是病毒学的重要课题，具有重要的理论和应用意义。早在1984，他就构建了我国痘苗病毒疫苗株(天坛株)的基因文库。经过10年的努力，该病毒的全基因组(189，274kb)已被测序和分析，这是目前我国最大的一个生命体的完整基因组序列，并有许多重要发现。1985年，他在《英国普通病毒学杂志》上首次报道了痘苗病毒基因组的HindⅲP片段，补充和修正了国外学者的结论，随后得到了其他国外学者的证实。1989年，他发现痘苗病毒血凝素是免疫球蛋白超家族的新成员，这是第一次报道一种已知功能的病毒蛋白属于这个家族。这项工作首先由英国牛津大学的同事验证，并由免疫球蛋白超家族权威Williams博士推荐给《美国实验医学杂志》发表，无需试验。随后，研究痘苗病毒的Moss博士(美国国立卫生研究院)、研究病毒免疫学的Oldstone博士(斯克里普斯临床研究基金会)、研究HLA分子结构的Wiley博士(哈佛大学)等相关国际权威科学家相继来信证实了这一发现，并给予高度评价。后来英美学者在这项工作的基础上继续发展，在痘苗病毒和其他痘苗病毒蛋白中发现了更多的免疫球蛋白超家族成员。研究结果被认为对研究病毒的起源和进化以及病毒与宿主的关系具有重要的启发意义，是该领域的先驱性工作。1990年，他发现痘苗病毒的hind ⅲ k片段编码一种丝氨酸蛋白酶抑制蛋白，可能与痘苗病毒的毒力有关。1992年，他发现我国痘苗病毒疫苗株的基因组序列与国外哥本哈根株有较大差异，为比较和阐明痘苗病毒的毒力机制提供了重要线索。上述研究成果表明，由他领导的我国痘苗病毒株基因组结构和功能的研究在国际上具有较高的学术地位。
8.其他医学病毒基因组的克隆和分析
他从中国妇女的疣组织中分离克隆了一种人乳头瘤病毒6型，经测序鉴定为世界上的新品种。他阐述了慢性宫颈炎的病毒病因，证明了乳头瘤病毒16、单纯疱疹病毒2、巨细胞病毒与慢性宫颈炎的发病密切相关。单纯疱疹病毒2型基因组基因文库。实验室已开发出多种基因工程细胞因子和淋巴因子，极大地促进了我国基因工程产品的产业化。
侯云德同志在国内外杂志上发表了250多篇科学论文。主要著作7部，部级以上国家级成果14项。1981年编著《干扰素及其临床应用》，是我国第一部关于干扰素研究的专著。这本书既有理论深度，又紧密联系临床实际，还总结了我国学者的研究成果。曾被评为1978-1981国家优秀科技。由他主编的65438-0985《病毒基因工程原理与方法》一书，是我国学者根据国内经验编写的第一部基因工程技术专著，对推动我国基因工程技术在医学病毒学中的应用具有重要作用。1990年，他编写了《分子病毒学》一书的所有章节，专业跨度很大。这部100多万字的专著系统介绍了各科病毒的分子结构和功能，总结了国内外和作者的研究成果，反映了80年代国际分子病毒学的研究进展，也是国内最全面、最系统的病毒学专著。1994 10第三届亚太医学病毒学大会肯定了他在医学病毒学方面的杰出贡献，并授予他荣誉奖。
侯云德院士从事医学病毒学研究50年。在干扰素等细胞因子和痘苗病毒的基因组结构和功能研究方面取得了重大成就，为我国医学分子病毒学和生物技术的发展做出了重大贡献。在国内外杂志上发表科学论文约400篇；部级以上主要著作9部、成果20余项；其中，国家科技进步一等奖1项，二等奖7项；国家自然科学二等奖1，卫生部科技进步一等奖10。获得7项国家新药证书。