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沉默的内源性DNA
Sde4,我们之前发现的拟南芥。
突变说展示的部分失去了转基因的光泽。
该路径在其他方面是依赖的。
依赖RNA的RNA聚合酶六天
(rdr6 ) ( 1).sde4突变植物还
缺陷小干扰RNA(小干扰RNA)
生产和甲基正弦反元素
Atsn1 (2)在路径后面。
与rdr2和Dicer相关的三天
(dcl3)和其他内源性siRNA (3)。它
很可能,这条沉默的路径是相关的。
RNA干扰(RNAi技术)介导异染色质化。
在裂殖酵母中
Pombe,这也依赖于小分子干扰RNA,Dicer,
第四章.所以为了调查。
机械和逆元件的两种转基因
沉默,我们研究的分子。
Sde4身份的轨迹。我们在这里所描述的。
sde4中最大亚单元1如何编码
编码RNA聚合酶不同于
真核细胞中的一种、两种和三种RNA聚合酶
(其亚单位在拟南芥中被指定。
分别通过前缀nrpa、nrpb或nrpc)。
根据《公约》
命名为RNA聚合酶,我们将从现在开始引用它
这种酶作为RNA聚合酶IV(含油种子)
(4)世界上最大的亚基代码sde4。
As nrpd1a。Sde4如前所述。
该突变现在被指定为nrpd1a-1。
诺里奇约翰建筑中心塞恩斯伯里实验室,1。
英国Nr4 7uh。2诺里奇东英格兰大学
英国Nr4 7tj。
*通信应发送给谁。
电子邮箱:David . baul combe @ It ' s Sainsbury-laboratory . AC . uk
屏幕上有缺陷的变种人,跨
拟南芥品系用于基因沉默。
(gxa),其中绿色荧光蛋白
(GFP)转基因(图s1a,命名为G)
沉默,由马铃薯X病毒(pvx)-绿色荧光蛋白
转基因(图s1a,名称1) (1)。不像
Rdr6突变体,其中绿色荧光蛋白完全丢失。
gxa背景中的静音,nrpd1a-1
显示了一张沉默中延迟攻击的图片
生长点处的植物(图1A和图。
s1f ) ( 1).在幼苗中,在叶子的早期阶段
绿色荧光蛋白的荧光出现了,一周之内,
沉默出现在局部地区,然后
散布在整个叶子上。这种延迟
表型持续到开花。
幼花序都是GFP荧光的。
这个模型的转基因mRNA
小分子会相应地干扰RNA的积累
绿色荧光蛋白的荧光量。因此,北
野生型和nrpd1a-1花的分析
这表明累积的GFP增加了。
pvx-绿色荧光蛋白基因的mRNA (4.5倍)和RNA的表达。
Nrpd1a-1对应于六倍缩减。
21-24天-核苷酸(nt)的绿色荧光蛋白siRNA(图
1B)相对野生型。完全沉默
玫瑰叶子,nrpd1a调解亏损的地方。
沉默并没有明显高于。
花、绿色荧光蛋白基因和siRNA量
可比。
RNA介导的DNA甲基化(rddm)
是无声的植物,而且
一种可能的小分子干扰RNA引导作用。
复杂。绿色荧光蛋白中的一致rddm
gxa植物中,绿色荧光蛋白基因的DNA甲基化轨迹是
Rdr6和sgs3突变体在花中丢失
23 。龙普法伊霍弗等人,威廉姆斯年。地中海。197 , 1525 ( 2003 ) 。
24 。勺子egawa等人,目前。生物。13 , 1252 ( 2003 ) 。
25 。由国民医疗服务体系支持(r37-ai33443)。我们认为
谢谢你,j .波伯,每小时十个孙子,还有d .罗斯坦。
仔细阅读这份手稿和第十森林(大学
水牛),为了分享card11的缺陷。
朱尔卡特细胞。分子相互作用数据已经
储存在生物分子相互作用网络中
数据库和登录代码209039至209044。
支持在线材料
www . science mag . org/CGI/content/full/308/5718/114/
无线TTL闪光灯
材料和方法
图中一至中三
165438+2004年10月4日;接受,2005年6月65438日+10月65438日+4月
10.1126/科学. 1107107
带有绿色荧光蛋白的SiRNA (1)(图1 C)。在nrpd1a-1中
花的siRNA,如绿色荧光蛋白,下降,但
没有缺席,我们只发现了一个微小的变化
绿色荧光蛋白的DNA甲基化模式(图1 C)
这种反差是更明显的损失。
Atsn1 DNA甲基化nrpd1a-1植物
( 2 , 5 ) 。所以,nrpd1a通道,不是吗?
唯一合适的siRNA是rddm。
当初nrpd1a-1还挺重排的。
染色体1紊乱
At1g63020(图中一、二至七),然后使用。
其他nrpd1a等位基因与。
同nrpd1a转确认
该基因编码nrpd1a。顺序
nrpd1a和拟南芥nrpd1a的非比对
同源(代码at2g40030)和两个
蛋白质是水稻特有的。
分支成最大亚单位的RNA
聚合酶(图2A和图s2,a至c)。
一致nrpd1a全球最大。
亚单位-多亚单位油四,大米
拟南芥基因组编码两个。
蛋白质可以是第二大。
亚单位(at3g18090和at3g23780) (6)
(图2B和图s2d)。测试静音
这些基因在拟南芥nrpd2中的作用
亚基,我们转化野生型gxa。
植物反向重复序列的构建
nrpd1a靶向RNAi,疑似
Nrpd2基因,或Adan(作为对照组)(图3,
a和b)。转换和红外
对于nrpd1a和疑似
Nrpd2基因,但不针对Adan(图3,C
和d)出现延迟发作的沉默。
这样的nrpd1a-1。虽然两个nrpd2
基因会被灭活,由红外线构建。
(图s3b),两条路线的证据表明,
主动nrpd2轨迹,不在3g23780。
相比at3g18090。首先,基因特异性逆转
转录聚合酶链反应(RT-PCR)
分析结果表明,大多数nrpd2
来自at3g23780(图s3e)
其次,插入了一个突变体at3g23780。
(nrpd2a-1,图s3f),而非at3g18090。
(nrpd2b-1,图s3f)消除了内源。
小分子干扰RNA(图3A)。
nrpd1a和nrpd2在顺序上有相同点也有不同点。
他们nrpa,nrpb,nrpc
同源物,在该区域的相应功能
酵母RNA聚合酶的重要特性
2005年4月1第一卷308 www.sciencemag.org科学
报告
图。1 。GFP沉默nrpd1a-(1) 1。紫外线照片gxa野生
型(WT)和nrpd1a-1开花植物。(二)绿色荧光蛋白的northern分析
花(VI)、茎(S)和叶(1)中mRNA和siRNA的表达由WT和SiRNA组成。
Nrpd1a-1 gxa工厂。(3)基因组DNA的Southern印迹分析和纯化
两(7)个。对于nrpd1a,区域和身份
Nrpb1包括一个N端箝位内核。
(20%),锌金属结合位点,活性。
网站(41%),漏斗和一些裂缝
域(初始,42%,最后淘汰,24%)。应该
nrpa1中的断裂域,
Nrpb1,nrpc1在nrpd1a中缺失。
(保守区7)(图s2b)。然而
c端夹钳芯(图s2b ),它定义了
在球形域结束之前
c端结构域(CTD是)nrpb1 (7),是
目前(23%相同)。Nrpd2有34%相同。
有nrpb2和保守区。
相应的结合位点很小。
核心亚单位(nrpb3/ac40,nrpb10,
Nrpb12)(图s2d),这就是思路的发挥。
作用于酶组件(7)。有多重
基因nrpb3/ac40,部分企业
他们可以知道石油四的细节。然而,对于
nrpb10和nrpb12只有两个基因。
拟南芥中的每一个,他们都可以分享。
油籽中的第四种和其他RNA聚合酶之间。
因为它们在其他真核生物中(8)。
最显著的区别
Nrpb1和nrpd1a位于C端。
Nrpd1,如水稻和拟南芥。
蛋白质有一个相似的C端。
半个未编码的蛋白质(有缺陷
叶绿体和叶片)调节S rRNA基因。
加工叶绿体(9)(图s2a)。这
c末端延伸,协调RNA
聚合酶活性和下游加工
步骤,以类似于
CTD是polii (8)的。组合书
不寻常的C末端和保守特征
正义RNA聚合酶显示波兰IV是。
活性RNA聚合酶及其重要区别
来自正义RNA聚合酶的一、二和三。
来自相同组织,如第(2)项,消化和甲基化敏感性。
发现酶sau96i是GFP。未甲基化的G和gxa sgs3系
作为对照。DNA片段大于新台币554元,是因为DNA。
甲基化。
图。2 。系统树
最大的(a)和
第二大RNA
聚合酶亚单位家族
从植物,蠕虫和
酵母。右边
向每棵树显示RNA
聚合酶灰色亚家族
和黑盒显示器。
拟南芥油四个亚基。
为了进一步探索出油的机理。
四介沉默,我们的另一个特点是
突变和GFP延迟沉默
(图s4a)。它有一个倒置的4号染色体。
这将破坏rdr2(图s4b,rdr2-3),并且
可以补充绿色荧光蛋白基因的沉默表型。
通过用野生型rdr2转化
基因组DNA(图s4a)。在这里变异,因为在
nrpd2a-1的每个nrpd1a突变和具有
获得较低金额的内源性新台币24元。
SiRNA(即atsn1、1003、02和组2),与
在野生型,而mir167量。
在(3)处不受影响(图3A)。这些siRNAs都是
台币24元左右,dcl3 Dicer是
参与其中的学生(3)。这是可能的。
因此,油四、rdr2、dcl3法
联合起来以沉默的方式。石油四将军
产生的RNA种类被复制到
双链RNA(双链RNA) rdr2。
这种双链RNA然后被加工成
小分子通过dcl3干扰RNA。
rdr2和rdp1的突变也
通过长期RNA,小分子干扰RNA基因位点。
然而,对小分子的相反作用会干扰RNA,
长期RNA在沉默中更丰富。
变种人。所以atsn1 RNA比较多。
富含nrpd1a和rdr2突变体。
在野生型植物中(图3 C),显示
它们不是石油成绩单。据推测,这
RNA的结果必须由RNA聚合酶III来确定
转录(10) atsn1是沉默。
油料植物tetra-rdr2-dcl3途径是野生型的。
植物。我们探测不到它,只要油四。
Atsn1推测这是因为
它们目前数量很少
是由被掩盖的更丰富的RNA产生的。
其他RNA聚合酶。
这种油的4-rdr 2-DC L3途径是相关的。
与2002年的group 2和siRNAs不同,它不是必需的。
Ago4或DNA甲基化(3)。然而
atsn1和1003点高度甲基化。
野生型植株中,nrpd1a为10000亩。
Www.sciencemag.org科学卷308 2005年4月1
报告
图。3 。分子指标沉默。(一)分析北方在九号、九号的位置;10车道nrpd1a-3车道11,nrpd 1a-4;12车道,nrpd2a-1车道13车道。
内源性小RNA:泳道1至8,gxa (C24)背景;第9道至nrpd2b-1。污渍被多次去除和重涂。(2)南区
13,中校背景-O. 1线,每克;泳道2,rdr2-3系,武昌rDNA的3个重复,4个重复,2个重复被nrpd1a的一系列等位基因消化,并与其他等位基因的消化进行比较。
独立RDR2-3 RDR2P:: RDR2T2资格线;5车道,nrpd 1a-1;泳道6和7,甲基化敏感酶hpaii。(C)内源性逆转录聚合酶链反应分析
两条独立的NRPD 1A-1 nrpd 1AP::NRPD 1t 2资格线;8巷nrpd 1a-2;Atsn1是rdr2-2和nrpd1a升高的突变体。
Tants(图3B),积累自己。
SiRNAs依赖于argonaute蛋白。
Ago4,从头DNA甲基转移酶
Drm1和DRM 2(5号、11号和12号),以及油。
四、rdr2、dcl3。在这些示例中,它
似乎我们已经在第一个庞贝中提出。
(13),即保持沉默涉及
自我强化的沉默路径就在其中。
油籽四介导的siRNA的产生是依赖的。
关于ago4介导的DNA甲基化
反之亦然。
这里可以,如第四卷所述
解决一个悖论染色质沉默
该机制依赖于RNA。如果
沉默基因转录由单个
聚合酶,这种依赖RNA的机制
不会因为压抑而稳定
从这些位点转录
还会导致沉默RNA的丢失。
然而,沉默特定的聚合酶图像
油四,可以抗染色质或DNA
修饰影响聚合酶一到三。
以此类推,可以稳稳地保持沉默。
状态。动物和真菌中油的四个分支
缺席,但沉默的悖论可能
解决了,如果有一种形式的RNA。
聚合酶1-3和沉默特异性
亚单位,它使转录的异染色质
因此,维护
依赖RNA的沉默。
最后,一般的沉默。
其机制是GFP交叉。
基因沉默与内源性siRNA
沉默的道路是依赖。
对于* * *和联盟蛋白(图1018)。在玫瑰叶子里
植物的这两条沉默的路径
是相互独立的,因为
基因沉默不受rdr2的影响(图1018)。
由于内源性24nt siRNA的持续存在
rdr6中的植物(2)。然而,在这些花中
因为绿色荧光蛋白。
沉默受到两个rdr2和rdr6的影响。
这种潜在的沉默途径相互作用,
结合自身能力形成
反馈和自我强化循环(14),解释
潜在复杂性内生
参与调控网络的SiRNAs。
参考和债券
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慈善基金会、生物技术和生物学
科学研究委员会,以及婴儿,学校
惠康基金和技术
援助的影响。
支持在线材料
www . science mag . org/CGI/content/full/1106910/DC 1
材料和方法
图表格1至表格4
表S1和S2
参考和债券
2004年10月29日10;接受,65438+2005年10月25日
2005年2月3日在网上发布;
10.1126/科学. 1106910
包括该信息,请参考该文档。
翻译算子基因
对于核糖体:如何抑制物质
蛋白质排除了核糖体结合。
拉斯·詹纳,1帕斯卡尔·龙比,2伯纳德·里斯,1
克莱门斯·舒尔茨-布里斯,第三名学生,施普林格,4尚塔尔·埃雷斯曼,2。
伯纳德·埃雷斯曼,2迪诺·莫拉斯,1古尔纳拉·尤苏波娃,1。
Yusupov 1,2 *
嗜热性核糖体从共结晶转移到赞助者。
Rna (tRNA分子)和结构完整的信使RNA (mRNA)携带翻译。
接线员。Road mRNA以5.5埃的分辨率定义。
比同样晶体结构的核糖体更复杂。
无结构mRNA表达缺失或同时表达。精确的核糖体环境
post操作符的茎环垂直于曲面。
这个平台上核糖体的1930年代亚单位。绑定运算符和
发起者的tRNA出现在核糖体和一个无人居住的tRNA被疏散的位点。
预计一开始会很复杂。定位监督
该域的操作者阐明了相对于核糖体的分子。
机制,即约束抑制子开关过度翻译。我们的数据
建议一般如何表达控制元素。
核糖体来完成它们的调节任务。
当最初的翻译得到普遍认可时,就需要快速的适应性。约定的
效率促进蛋白质的合成,蛋白质是真细菌核糖体中涉及的几种元素。
关键的一步是控制基因的表达,基因影响研究的动态。
2005年4月1第一卷308 www.sciencemag.org科学
我希望和你成为朋友