复旦大学上海医学院办学
十一五规划的三部优秀教材。
“十二五”第一批规划教材17
16全国优秀博士学位论文。
(截至2014)科研奖励复旦大学附属华山医院朱教授领衔的“脑组织修复重建、细胞示踪技术及转化应用”项目获2014年度国家科技进步二等奖，中山医院教授领衔的“专家解答腰椎间盘突出”项目获2014年度国家科技进步二等奖(科普)。2013年底，中华医学奖序号水平项目名称主要由1完成，二级川崎病冠状动脉病变的流行病学、黄国英儿科医院二级青光眼视网膜神经保护新策略的临床治疗和预测指标研究及应用研究；孙兴怀眼耳鼻喉科医院发现三级硫化氢的多靶点心血管保护作用及其受体:朱宜春基础医学院第四系结核滞留和潜伏感染的机制及临床诊断:张文泓附属华山医院。5三级胆道闭锁的发病机制及临床规范化诊疗研究6郑山附属儿科医院卫生政策奖——郝的开创性成果卫生学院黄家思教授在中山医院创办胸外科。
沈克飞教授完成了中国首例开颅手术。
史美心教授研制成功国内第一台人工心肺机。
崔志毅教授成功地在世界上开创了丝绸血管
杨东岳教授在世界上开创了足趾移植成功的先河。
唐兆友教授提出了小肝癌早期诊治的新概念。
黄鹤年教授完成了世界首例创新喉重建的收集。复旦大学医学图书馆创建于1927，前身为国立上海医学院图书馆，1959更名为上海第一医学院图书馆，5月1985更名为上海医科大学图书馆。2000年4月27日，上海医科大学与复旦大学合并，更名为复旦大学医学图书馆。
复旦医学图书馆藏书40多万册，以基础医学、临床医学、药学、预防医学、法医学、护理学等中英文书刊为主。校园网用户可以通过复旦医学图书馆主页访问中国生物医学文献数据库(CBM)、中国学术期刊网络出版数据库、中国科技期刊数据库、万方数据知识服务平台、知网、EMBase、Proquest、OVID医学全文数据库、EBSCO的学术搜索精英、Elsevier的ScienceDirect、Kluwer等200多个数据库。学术资源门户MetaLib/SFX提供电子期刊的跨数据库检索和全文查询链接。
复旦医学图书馆是中国高校医学图书馆协会副理事长，全国高校医学图书馆协作网华东地区中心，全国医学文献检索教学研究会名誉主席、副主席，CALIS医学中心主要成员。学术期刊《复旦学报(医学版)》:由复旦大学主办，教育部主管的医疗卫生综合性学术核心期刊。其前身是《上海医科大学学报》，创办于6月1956。主要发表基础医学、临床医学、药学、预防医学等领域的原创性研究论文。
中华眼耳鼻喉科杂志:由教育部主管，复旦大学附属眼耳鼻喉科医院主办的全国性专业学术期刊。是中国科技核心期刊(中国科技论文统计源期刊)，复旦大学。董事长、总编辑孙兴怀、迟。已被万芳数据、中国知网、重庆维普数据库全文收录。
《中国循证儿科学杂志》:由复旦大学主办，教育部主管，桂永浩主编的儿科学术技术期刊。杂志双月刊，全年7期(含增刊1)。发表文章42篇，专家对话7场，讲座2场，评论10篇，病例讨论2篇，病历报告7份。
中国临床神经科学杂志:姜玉萍主编。是由教育部、复旦大学附属华山医院、复旦大学神经病学研究所主办的医疗卫生科技期刊。2000年以来，被中国科技论文统计源期刊、中国学术期刊综合评价数据库等5种期刊数据库收录，被评为中国科技核心期刊。
中华医学计算机影像杂志:名誉主编陈，主编沈天珍。该杂志由教育部、复旦大学上海医学院和复旦大学附属华山医院主办。编辑部的日常工作由复旦大学附属华山医院负责。这些杂志是中国科技期刊和中国学术期刊(核心期刊)。
中华手外科杂志:主编顾玉东是中华医学会主办的手外科学术期刊。该杂志已加入中国科学引文数据库(CSCD)、中国学术期刊综合评价数据库、中国期刊全文数据库、中国数字期刊全文数据库和中国科技期刊数据库。
中国临床医学:杨炳辉主编。本刊是由教育部主管的复旦大学附属中山医院主办的临床医学学术期刊。是中国科技核心期刊，中国科技论文统计源期刊，中国科学引文数据库源期刊。被中国期刊全文数据(CJFD)和万方数据库数字期刊全文收录；已被国家图书馆、中国版图书馆、上海图书馆全文收录。
中国肿瘤学:沈主编。本刊是由教育部和复旦大学附属肿瘤医院主办的全国性肿瘤学学术期刊。被《中国期刊网》、《中国学术期刊(光盘版)》全文收录；入选“中国学术期刊综合评价数据源期刊”；加入“万方数据库-数字期刊群”进行全文在线，被纳入“中国核心期刊(精选)数据库”；被北京大学图书馆中文核心期刊收录为中文核心期刊。