枯草芽孢杆菌的镜检及生理生化反应

首先，我建议你直接和导师沟通这些问题。我想他会给你一个明确的答案，对你的研究思路会很有帮助。

以下是根据我个人理解给出的回答或建议:

一、镜检的目的应该是让你熟悉枯草芽孢杆菌的个体形态和孢子特征，这是进一步菌株分类和状态鉴定的需要。

二、生理生化实验的目的同上，应该主要是鉴定菌种的分类地位，或者让你熟悉菌种鉴定的流程。也不排除需要研究这一菌株的具体功能。

3.菌落形态是菌株鉴定的重要依据，但不是充分必要条件。如果严格鉴定菌株的分类地位，需要采用多重分类，从多个角度分析菌株，运用各种原理不同的方法和技术进行综合判断。有三个一般步骤:

1.形态鉴定:个体形态、群体形态、革兰氏染色、基本结构、特殊结构等。

2.分子鉴定:提取纯菌DNA样本，扩增16SrDNA并测序。测序结果在NCBI网站上公布，初步确定了该属的一级分类单元。

3.理化分析:碳氮源利用、产酶特性、代谢产物等鉴定特征。应根据前两次分析的结果并结合伯杰的《系统细菌学手册》进行检验。一般需要检测至少20项理化指标，很多可以达到100以上。一般可以鉴定到“种”的一级分类单元

如果以上三步仍不能确定菌株的分类地位，则需要进一步分析，如DNA杂交、化学成分分析等。，如果需要，可以确定整个序列。

4.常用于细菌鉴定的生理生化包括淀粉水解试验、糖发酵试验、甲基红(MR)试验、vp试验、明胶液化试验、硫化氢产生试验等。建议参考伯杰的《系统细菌学手册》或董秀珠主编的《常见细菌系统鉴定手册》。另外，对于一般的教学或验证性实验，可以查阅《普通微生物学实验手册》。